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AAV超遠心後のウイルスバンドはどこに現れる？

Dec 04 , 2025
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AAV の密度勾配超遠心では、主に ヨードキサノール（iodixanol）勾配 と CsCl（塩化セシウム）勾配 が使用されます。
それぞれでウイルスバンドの位置が異なります。

① ヨードキサノール密度勾配（最も一般的）

典型的な4層構成：15% / 25% / 40% / 60%

✅ AAVウイルス粒子のバンド：40% と 60% の境界付近

  • AAV 粒子の密度は 約 1.4 g/mL

  • そのため 40%（約1.32 g/mL）と 60%（約1.41 g/mL）層の境界に沈降する

  • バンドは白濁した層として見える

📌 補足

  • 空カプシド（empty capsid）：やや上層寄り（40%側）

  • 完全カプシド（full capsid）：やや下層寄り（60%側）
    ※ ただし iodixanol では Empty/Full の完全分離は困難

② CsCl 密度勾配（Empty / Full の分離が可能）

✅ Full AAV（完全カプシド）：密度 約 1.40 g/mL → より下層に形成

🌫️ Empty capsid（空カプシド）：密度 1.32–1.35 g/mL → 上層に形成

観察されるバンド：

  • 上層：空カプシド（Empty）バンド

  • 下層：完全カプシド（Full）バンド（通常より明瞭）

CsCl は分離性能が高い一方、ウイルス活性低下のリスクがあるため、現在は iodixanol＋クロマトグラフィーが主流。

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