業界、ゲノム編集療法におけるNGS安全性評価に関するFDAガイダンス草案を支持する一方、さらなる明確化を要請

uly 17, 2026 —

製薬業界は、ヒトゲノム編集（GE）治療薬の安全性評価における次世代シーケンシング（NGS）の活用に関して、米国食品医薬品局（FDA）が提示したガイダンス草案を広く支持している。一方で、業界団体はオフターゲット編集解析、標的候補部位の選定（サイトノミネーション）手法、および製造工程の変更に伴う規制上の要件について、さらなる明確化を求めている。

FDAは2026年4月に本ガイダンス草案を発出しており、ヒトゲノム編集製品の臨床試験開始に向けた非臨床研究で用いられるNGSベースの手法に焦点を当てている。意見募集の期限までに、規制当局には30件以上のパブリックコメントが寄せられた。

米国バイオテクノロジーイノベーション協会（BIO）、米国研究製薬工業協会（PhRMA）、イーライリリーなどの業界団体・企業は、本ガイダンスについて、ゲノム編集療法における予測可能性が高く科学的根拠に基づいた規制枠組みの構築に向けた重要な一歩として歓迎した。

PhRMAは、潜在的なオフターゲット編集やゲノム整合性（genome integrity）リスクを評価するためにNGS技術を適用する上で、本草案が有用な推奨事項を提供していると評価した。BIOもまた、シーケンシング手法の選定、バイオインフォマティクスの透明性、バリアント（遺伝子変異）に配慮した解析、クロマチン整合性評価などの方向性を示したFDAのリスクベースアプローチを支持した。

明確化が特に求められている主要分野の一つが、in vivo ゲノム編集製品におけるオフターゲット編集解析である。草案では、目的とする標的組織を代表する細胞種を用い、想定されるオンターゲット編集率を達成する編集条件で解析を行うことを推奨している。適切な細胞が得られない、あるいは in vitro での使用が困難な場合、治験依頼者（スポンサー）は代替アプローチの妥当性を説明することができる。

BIOおよびリリーは、オフターゲット解析において非標的組織をどの時点で含める必要があるかをより明確に定義すべきであると指摘した。強い組織指向性（トロピズム）を持ち、目的外組織への暴露が限られる in vivo 製品の場合、高濃度の in vitro 条件で非標的細胞種を試験することは、臨床外挿性（translational relevance）に乏しい可能性があると企業側は主張している。

また、オフターゲット候補部位の選定手法に関しても明確化が要望された。草案では、オフターゲット候補部位の特定手法として in silico 手法、生化学的アッセイ、および細胞ベースのアッセイを挙げている。これに対しBIOおよびリリーは、3つのアプローチすべてが常に要求されるわけではなく、モダリティに応じた適切な組み合わせが許容され得ることをFDAが明記するよう推奨した。

この点は、従来のヌクレアーゼベースのシステムを超えてゲノム編集技術が多様化する中で、特に重要性を増している。ベースエディター、ニッカーゼベースのシステム、エピゲノムエディター、トランスクリプトームエディターなどでは、その作用機序に応じて、異なる候補選定ツールが異なる感度と有用性を示すためである。

フィードバックのもう一つの大きなテーマは、製造工程の変更後に求められる品質・製造・品質管理（CMC）上の対応である。草案では、プロセスにおける重大な変更がエディターの活性やオンターゲット編集率に影響を与え、オフターゲットプロファイルが変化する可能性がある場合には、追加のオフターゲット解析が必要になる場合があると規定している。

再生医療振興同盟（ARM）およびPhRMAは、特に開発後期、スケールアップ、および生物学的に適正な製品の承認申請（BLA）準備段階において、製造変更後にどのようなレベルの解析が期待されるのか、より詳細なガイドラインを求めた。業界側は、治験用プロセスと商用プロセスの同等性を評価するブリッジング試験に関する明確な原則があれば、治験依頼者にとって有益であると述べている。

さらにPhRMAは、新規ゲノム編集製品を開発するスポンサーに対し、INTERACT会議やIND前（Pre-IND）会議へのタイムリーなアクセスを保障するようFDAに促した。草案ではオフターゲット研究計画に関する早期の規制協議が推奨されているものの、ゲノム編集特有の課題について協議する機会をタイムリーに得ることが困難であるとの報告がスポンサー側からなされているとPhRMAは指摘した。

全体として、提出されたコメントは、ゲノム編集療法におけるNGS基準の安全性要件を確立しようとするFDAの取り組みへの広範な支持を示すと同時に、編集技術、投与プラットフォーム、および製造プロセスの進化に合わせて柔軟性を持たせる必要性を浮き彫りにしている。