AAVはノックダウンと過剰発現のどちらに適していますか？

結論として、AAVは遺伝子の過剰発現（Overexpression）に非常に適しており、ノックダウンも可能ですが、強力で精密なノックダウン用途には制限があります。

1. AAVは遺伝子過剰発現（Overexpression）に最適です

AAVは、遺伝子過剰発現研究で最も一般的に使用されるウイルスベクターの一つです。

主な理由：

• AAVは主にエピソーマル（染色体非統合）として存在し、安定した外来遺伝子発現が可能です。

• 神経細胞や心筋細胞などの非分裂細胞で長期間発現します。

• CAG、CMV、EF1α、組織特異的プロモーターなど選択肢が豊富です。

• in vivo 実験に適しており、免疫原性が比較的低いことが特徴です。

主な用途：

• 遺伝子機能の強化解析

• レポーター遺伝子（GFP、mCherry、Luciferase）

• 疾患モデルにおける遺伝子補完

• 治療遺伝子・分泌タンパク質の発現

👉 AAVは過剰発現用途の第一選択です。

2. AAVによるノックダウンは可能だが制限があります

AAVを用いたノックダウンは、遺伝子を直接破壊するのではなく、抑制因子を発現させる方法が一般的です。

代表的な手法：

• shRNA

• miRNA／artificial miRNA

• CRISPRi（dCas9 + sgRNA）

制限点：

• ノックダウン効率は通常 50～80%程度で、レンチウイルスより低い場合があります。

• 効果は MOI（感染量）に大きく依存します。

• shRNAは特に神経系で細胞毒性のリスクがあります。

• 誘導型・可逆的制御が困難です。

👉 in vivoでの長期・穏やかな抑制には使用可能ですが、

👉 in vitroで強力なノックダウンを求める場合には最適とは言えません。

3. AAVはノックアウト（KO）に適していますか？

AAV単独での遺伝子ノックアウトには適していません。

ただし、以下のような補助的ツールとしては利用されます：

• AAV-Creによる条件付きノックアウトマウス

• Cas9トランスジェニック動物へのsgRNA送達

• SaCas9など小型Cas9の送達（容量制限あり）

👉 AAVはKOの“トリガー”として機能しますが、完全なKOソリューションではありません。

AAVは遺伝子過剰発現に最も適しており、

ノックダウンも可能ですが、主にin vivoでの長期・緩やかな抑制向きです。